我們需要基因晶片跟次世代定序嗎？

我們需要基因晶片跟次世代定序嗎？

很多同學問

所以今天颱風天來聊一下好了

我們二十幾年前就在台灣開始做基因晶片產前檢測

也是全世界最早把這項技術帶進產前診斷的團隊之一

這二十年來

基因晶片最大的價值

就是把傳統染色體檢查看不到的微缺失微重複找出來

像是小胖威利症候群

迪喬治氏症候群

這些大家可能比較少聽過的疾病

單一疾病雖然都不常見

但全部加起來

盛行率其實跟大家熟悉的唐氏症差不多

所以晶片的重要性

我相信大家現在都已經很熟悉了

今天就不再多談

那

有了染色體加晶片

是不是就夠了？

其實也不盡然

如果把基因診斷想成三層

第一層

染色體

看的是數目跟大的結構異常

第二層

基因晶片

補上染色體看不到的微缺失跟微重複

但還有第三層

那就是單一基因疾病

這一塊

不管是染色體還是晶片

都看不到

其中

隱性遺傳疾病

可以透過帶因檢測來預防

只要夫妻剛好都帶有同一個致病基因

下一代才有較高機率受到影響

所以孕前或孕期先幫爸爸媽媽做帶因檢測

一直都是很重要的一環

可是

顯性遺傳疾病就沒有那麼簡單了

很多人會問

沒有家族史是不是就不用擔心？

答案是不一定

因為不少顯性疾病

其實都是新發生的突變

也就是 de novo mutation

爸爸媽媽都沒有

家族裡也沒有

自然不可能從家族史看出來

這種情況

只能直接分析胎兒本身的基因

所以

現在一個完整的產前診斷

其實可以分成三個層次

第一層

染色體

第二層

基因晶片

第三層

次世代定序

補上單一基因疾病

講到這裡

很多人可能會想

那乾脆一次全部都驗不是最好嗎？

理論上可以

全外顯子定序

甚至全基因體定序

現在技術上都做得到

但現實有兩個限制

第一個是成本

檢測範圍越大

費用自然越高

第二個反而更重要

驗得越多

就越容易找到一些不知道到底有沒有臨床意義的變異

醫學上稱為 VUS

（Variant of Uncertain Significance）

報告看起來很精彩

卻不一定能回答真正的問題

有時候

反而只增加焦慮

所以

真正重要的

從來不是驗得越多越好

而是在檢測範圍

成本

以及臨床價值之間

找到最適合自己的平衡

這也是為什麼

我們會設計成不同的檢測等級

v1.0

以 Oligo 晶片為基礎

一次完成染色體與微缺失微重複分析

也是目前國際產前診斷指引建議的重要基礎檢查

v2.0

除了晶片之外

再加入骨骼發育異常相關基因分析

因為許多骨骼疾病

本來就是單一基因造成

晶片驗不到

如果超音波已經看到疑似長骨過短等異常

透過定序檢測

診斷率可以大幅提升

v3.0

再把範圍擴大

涵蓋發展遲緩

智能障礙

肌肉

心臟

血液等常見相關疾病

PRO

則是在晶片之外

加入大規模次世代定序

一次分析五百多個基因

也是目前台灣產前檢測中

涵蓋範圍最完整的方案之一

簡單來說

如果超音波正常

其他檢查也沒有特殊發現

其實依照自己的需求

在不同等級中選擇一種

大多就已經足夠

畢竟它比較像保險

保障要做到什麼程度

每個人的答案都不一樣

但如果胎兒已經出現特殊結構異常

或臨床高度懷疑特定疾病

這時候

醫師就可能建議進一步做到全外顯子分析

沒有哪一種檢查適合所有人

真正重要的

一直都是在對的時間替對的人選擇最合適的工具

就醬

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